Disk1

1. ニンニンゲーム
2. さぁ行け！ニンニンジャー！　（ＴＶサイズ２）
3. ラストニンジャレース　スタート！
4. 家族団欒　忍ジャパン
5. 謀略の館
6. たまには忍ぶゼ
7. うなれ一番刀！
8. ギンギラニン！ニンニンジャー　（インストゥルメンタル）
9. 恐れの響き
10. 巨大妖怪　傍若無人
11. 驚愕！カラクリキュウビ出現
12. 熱く燃えろ！
13. 忍ばずわっしょい！シュリケンジン　（インストゥルメンタル）
14. 心　忍ばせて
15. 断ち切れぬ想い
16. 悲鳴の狩人
17. 秘術応酬
18. オトモなれども暴れるゼ！
19. 超絶ライオンハオー！　（超絶ニンニンジャーｖｅｒ．）
20. テングの神隠し　（ボーナス・トラック）
21. なんじゃモンじゃ！ニンジャ祭り！　（天岩戸　ｖｅｒ．）　（ボーナス・トラック）

Disk2

1. 忍んでる場合じゃない！！　（インストゥルメンタル）
2. Ｎｏｔ　Ｅａｓｙ　！！
3. 体験ＲＰＧ　「ラストニンジャへの道」
4. 忍ぶどころか慌てるぜ
5. 高めろ！忍タリティ！！　（インストゥルメンタル）
6. 暗い煌めき
7. 闇の同盟
8. 決めろ！一斉忍烈斬
9. さぁ行け！ニンニンジャー！　（インストゥルメンタル・ショート　ｖｅｒ．）
10. 声なき慟哭
11. 迷いの星
12. スターニンジャー☆パーリナイッ！！　（インストゥルメンタル）
13. 終わりの手裏剣
14. 大復活！牙鬼幻月
15. ぶっぱなせ情熱を！！
16. さぁ行け！ニンニンジャー！　（アクション　ｖｅｒ．）
17. 全オトモ忍総進撃！
18. 超絶ライオンハオー！　（インストゥルメンタル）
19. 忍ばず大勝利
20. なんじゃモンじゃ！ニンジャ祭り！　（インストゥルメンタル）
21. 次回！！
22. さぁ行け！ニンニンジャー！　（ＰＲ　ｖｅｒ．）

Disk3

1. 旅の始まり　（映画　Ｍ１）
2. なんじゃモンじゃ！ニンジャ祭り！　～Ｒｏｃｋ☆Ｓｔａｒ　ｖｅｒ．～　（映画　Ｍ２）
3. 迎えの美少女　（映画　Ｍ３）
4. ケバブ…？　（映画　Ｍ４）
5. 夢のスパイミッション　（映画　Ｍ５）
6. 緑の残像　（映画　Ｍ６）
7. けん玉探偵ヒカリ　Ｒｅｔｕｒｎｓ（Ａ）～（Ｂ）　（映画　Ｍ７ａ～ｂ）
8. そして誰もいなくなる？　（映画　Ｍ８）
9. 「ローエングリン」　より婚礼の合唱　（映画　Ｍ９）
10. ちょっと待ったァーッ！　（映画　Ｍ１０）
11. 招かれざるジュッカラゲ　（映画　Ｍ１１）
12. 妖怪烈車　（映画　Ｍ１２）
13. メインタイトル　（映画　Ｍ１３）
14. 半分くらい分かった　（映画　Ｍ１４）
15. Ｂａｔｔｌｅ　ｉｎ　ｔｈｅ　ｔｒａｉｎ　（映画　Ｍ１５）
16. 到着、闇忍者ランド　（映画　Ｍ１６）
17. 闇博士マーブロ～シャドー忍法乱舞　（映画　Ｍ１７～１８）
18. ハイブリッド闇アカニンジャー　（映画　Ｍ１９）
19. 天晴が…消える！？　（映画　Ｍ２０）
20. 旋風の迷い　（映画　Ｍ２１）
21. 異変　（映画　Ｍ２２）
22. 俺に似ている誰か　（映画　Ｍ２３）
23. 家族のために　（映画　Ｍ２４）
24. 俺たちはニンジャだ　（映画　Ｍ２５）
25. 闇波動　拡散　（映画　Ｍ２６）
26. 赤き疾風　（映画　Ｍ２７）
27. 超特急！超分身！！　（映画　Ｍ２８）
28. 選ばれし美脚…？　（映画　Ｍ２９）
29. 手裏剣忍法扇風機ガール　（映画　Ｍ３０）
30. 達人　（映画　Ｍ３１）
31. 大突撃　（映画　Ｍ３２）
32. 俺の仕事場　（映画　Ｍ３３）
33. 特急６号緊急発進　（映画　Ｍ３４）
34. 更なる闇を！　（映画　Ｍ３５ａ）
35. 謎の戦士　（映画　Ｍ３５ｂ）
36. 縦横無尽！アニマルパワー　（映画　Ｍ３５ｃ）
37. 激烈！漆黒の炎　（映画　Ｍ３６）
38. レインボーラッシュ赤ピーマン！　（映画　Ｍ３７）
39. 天晴、消滅　（映画　Ｍ３８）
40. 夢見る力　（映画　Ｍ３９）
41. 帰ろう！！　（映画　Ｍ４０）
42. 帰還　（映画　Ｍ４１）
43. 忍タリティ＋イマジネーション　（映画　Ｍ４２）
44. 手裏剣特急大変身！～勝利のパーリナイッ！　（映画　Ｍ４３～４４）
45. 忍ぶどころか出発進行！！　（映画　Ｍ４５）
46. 撃ちます斬ります！手裏剣忍法　（映画　Ｍ４６）
47. マーブロの本気　（映画　Ｍ４７）
48. 特急忍烈斬！！　（映画　Ｍ４８）
49. 巨大な闇　（映画　Ｍ４９）
50. 重量級総力戦　（映画　Ｍ５０）
51. 超超クライナーロボ猛攻　（映画　Ｍ５１）
52. 完成！覇王トッキュウダイオー　（映画　Ｍ５２）
53. 激勝！忍ばずワッショイ！！　（映画　Ｍ５３）
54. 帰る場所へ　（映画　Ｍ５４）
55. なんじゃモンじゃ！ニンジャ祭り！　～忍ばず出発進行！　ｖｅｒ．～　（映画　Ｍ５５）
56. おかえり　（映画　Ｍ５６）